| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | tetra chicken | chr10 (359) | chr2 (856) | chr12 (376) | chr14 (273) | chr8 (864) | chr1 (294) | chr16 (229) | chr4 (352) | chr9 (1064) | chr5 (543) | chr3 (658) | chr15 (228) | chr6 (401) | chr7 (982) | chr21 (194) | chr17 (259) | chr19 (198) | chr13 (203) | chr18 (307) | chr11 (169) | chr20 (63) |
| 5 (931) | 147 (13) 37 (4) | 24 (25) 9 (8) | | 20 (8) 8 (2) | 21 (18) 8 (6) | | 2 (6) 1 (2) | 2 (7) 1 (3) | 6 (23) 3 (8) | 28 (14) 10 (5) | 4 (14) 2 (5) | 9 (6) 4 (2) | 4 (11) 2 (3) | 39 (20) 12 (8) | 3 (3) 1 (1) | 4 (7) 1 (2) | 2 (5) 1 (1) | 16 (6) 6 (2) | 5 (7) 2 (2) | | |
| 7 (561) | | 120 (15) 27 (4) | | | 2 (11) 1 (3) | | | | 15 (14) 5 (5) | 2 (8) 1 (3) | 19 (8) 8 (3) | | 2 (6) 1 (2) | 2 (12) 1 (4) | | | 2 (3) 1 (1) | | | | |
| 15 (374) | | 3 (10) 1 (3) | 85 (4) 20 (1) | | 2 (7) 1 (2) | | 4 (2) 2 (0) | 6 (3) 3 (1) | 3 (9) 1 (3) | 8 (5) 2 (2) | 4 (5) 2 (2) | 9 (2) 4 (0) | | 4 (8) 2 (3) | | | 2 (2) 1 (0) | 4 (2) 1 (0) | 5 (3) 2 (1) | 2 (1) 1 (0) | |
| 3 (1267) | 56 (18) 17 (5) | 17 (34) 6 (10) | | 108 (12) 32 (4) | 40 (25) 11 (9) | | 15 (8) 6 (3) | 3 (10) 1 (4) | 30 (32) 13 (11) | 43 (19) 13 (7) | 2 (19) 1 (7) | 4 (8) 2 (3) | 12 (15) 6 (5) | 15 (28) 7 (10) | 4 (5) 2 (2) | 50 (10) 13 (3) | 10 (7) 5 (2) | | 11 (10) 5 (3) | | |
| 2 (1432) | | 13 (39) 5 (12) | 3 (16) 1 (4) | 13 (13) 6 (4) | 107 (28) 32 (10) | 2 (13) 1 (4) | 2 (10) 1 (3) | 4 (11) 2 (4) | 52 (36) 20 (13) | 12 (22) 6 (8) | 21 (21) 8 (8) | 28 (9) 8 (3) | 66 (17) 20 (6) | 9 (32) 4 (12) | 43 (6) 16 (2) | 6 (11) 3 (4) | 2 (7) 1 (3) | | 2 (11) 1 (4) | | 5 (1) 2 (0) |
| 8 (561) | 2 (8) 1 (2) | 5 (15) 2 (4) | | | 16 (11) 6 (3) | 56 (5) 14 (1) | 2 (3) 1 (1) | 4 (4) 1 (1) | 11 (14) 4 (5) | 9 (8) 4 (3) | 18 (8) 7 (3) | 14 (3) 5 (1) | 20 (6) 8 (2) | | | | 2 (3) 1 (1) | | 5 (4) 2 (1) | | |
| 19 (332) | 5 (4) 2 (1) | | | | 4 (6) 2 (2) | | 37 (2) 11 (0) | | 4 (8) 1 (3) | 4 (5) 2 (1) | 4 (5) 2 (2) | | | 45 (7) 14 (2) | | | | | | | |
| 17 (313) | | | 9 (3) 3 (1) | | 5 (6) 2 (2) | | | 36 (2) 14 (1) | | 2 (4) 1 (1) | 3 (4) 1 (1) | | | 16 (7) 7 (2) | | | 2 (1) 1 (0) | | | | |
| 21 (231) | 2 (3) 1 (1) | | | | 4 (4) 1 (1) | | | | 44 (5) 13 (2) | | 15 (3) 7 (1) | 3 (1) 1 (0) | 2 (2) 1 (0) | 2 (5) 1 (1) | 3 (0) 1 (0) | 4 (1) 2 (0) | 2 (1) 1 (0) | | | 11 (0) 5 (0) | 2 (0) 1 (0) |
| 10 (421) | | 15 (11) 7 (3) | | | 2 (8) 1 (2) | | 2 (2) 1 (1) | 2 (3) 1 (1) | 36 (10) 11 (3) | 35 (6) 12 (2) | 7 (6) 3 (2) | 15 (2) 5 (1) | 8 (5) 2 (1) | 20 (9) 6 (3) | | 2 (3) 1 (1) | | 20 (2) 8 (1) | | | |
| 14 (518) | | 38 (14) 12 (4) | 2 (5) 1 (1) | | 8 (10) 3 (3) | 10 (5) 4 (1) | | 8 (4) 4 (1) | 12 (13) 4 (4) | 9 (7) 4 (2) | 30 (7) 11 (3) | | 4 (6) 2 (2) | 16 (11) 7 (4) | 2 (2) 1 (0) | 8 (4) 3 (1) | | 2 (3) 1 (1) | 12 (4) 4 (1) | | |
| 9 (463) | 6 (6) 3 (2) | 4 (12) 2 (4) | | | 15 (9) 6 (3) | 11 (4) 3 (1) | 6 (3) 2 (1) | 2 (3) 1 (1) | 2 (11) 1 (4) | 10 (7) 4 (2) | 9 (7) 4 (2) | 20 (3) 9 (1) | 10 (5) 3 (1) | | | 15 (3) 5 (1) | 2 (2) 1 (0) | | 5 (3) 2 (1) | | |
| 1 (2080) | 2 (29) 1 (9) | 157 (57) 49 (17) | | | 36 (41) 13 (14) | 4 (20) 2 (6) | 31 (14) 10 (5) | 14 (17) 6 (7) | 48 (52) 17 (19) | 36 (32) 13 (11) | 32 (31) 14 (12) | 8 (14) 3 (5) | 46 (25) 18 (8) | 69 (46) 26 (17) | 2 (8) 1 (3) | 8 (17) 3 (5) | 52 (11) 17 (4) | 57 (14) 19 (5) | 10 (17) 4 (5) | 2 (8) 1 (3) | 5 (2) 2 (1) |
| Z (369) | | 2 (10) 1 (3) | 42 (4) 14 (1) | | 4 (7) 2 (2) | 2 (3) 1 (1) | | 15 (3) 7 (1) | 2 (9) 1 (3) | 5 (5) 2 (2) | 2 (5) 1 (2) | | 5 (4) 2 (1) | 3 (8) 1 (3) | | 2 (3) 1 (1) | | 4 (2) 1 (0) | 10 (3) 3 (1) | | |
| 4 (1178) | 11 (16) 5 (5) | 16 (32) 6 (10) | 18 (13) 6 (4) | 15 (11) 4 (3) | 8 (23) 4 (8) | 51 (11) 16 (3) | 2 (8) 1 (2) | 7 (9) 3 (4) | 27 (29) 12 (11) | 8 (18) 4 (6) | 11 (18) 3 (7) | | 20 (14) 5 (5) | 23 (26) 10 (10) | 3 (4) 1 (1) | 2 (9) 1 (3) | 7 (6) 3 (2) | 3 (8) 1 (2) | 43 (9) 12 (3) | | 7 (1) 3 (0) |
| 13 (352) | | 4 (9) 2 (3) | | 11 (3) 5 (1) | | 15 (3) 4 (1) | | 2 (2) 1 (1) | 5 (8) 2 (3) | 2 (5) 1 (1) | | | | 43 (7) 17 (3) | | 2 (2) 1 (0) | 7 (1) 3 (0) | | | 2 (1) 1 (0) | |
| 6 (549) | | 23 (15) 5 (4) | | | 14 (10) 5 (3) | 3 (5) 1 (1) | | | 10 (13) 4 (5) | 10 (8) 3 (3) | 23 (8) 9 (3) | | 2 (6) 1 (2) | 18 (12) 7 (4) | | 30 (4) 11 (1) | 2 (3) 1 (1) | 5 (3) 2 (1) | 10 (4) 4 (1) | | |
| 12 (369) | | 12 (10) 4 (3) | | | | | | 7 (3) 2 (1) | 38 (9) 12 (3) | 4 (5) 2 (2) | | | | 16 (8) 6 (3) | | | | | 8 (3) 2 (1) | 19 (1) 8 (0) | |
| 20 (361) | | | | | 7 (7) 3 (2) | | 2 (2) 1 (0) | | 36 (9) 13 (3) | | 6 (5) 3 (2) | 4 (2) 1 (0) | 2 (4) 1 (1) | 4 (8) 2 (3) | 3 (1) 1 (0) | | | | | 5 (1) 2 (0) | |
| 11 (304) | | | | | | | 3 (2) 1 (0) | | 11 (7) 5 (2) | 25 (4) 6 (1) | | | 3 (3) 1 (1) | 12 (6) 6 (2) | | 3 (2) 1 (0) | 4 (1) 1 (0) | 6 (2) 2 (0) | | | |
| 26 (185) | | | | | | | | | 10 (4) 3 (1) | | 5 (2) 2 (1) | | | 3 (4) 1 (1) | | | | | 3 (1) 1 (0) | 16 (0) 7 (0) | |
| 23 (212) | 19 (3) 8 (0) | | | | 10 (4) 4 (1) | | | | 5 (5) 2 (1) | 4 (3) 2 (1) | 4 (3) 2 (1) | | | | 10 (0) 3 (0) | | | | | | |
| 27 (116) | | 2 (3) 1 (1) | | | 4 (2) 2 (0) | | | | 2 (2) 1 (1) | | 16 (1) 5 (0) | | | | | | | | 3 (0) 1 (0) | | |
| 24 (185) | 2 (2) 1 (0) | | | | 9 (3) 4 (1) | | 12 (1) 4 (0) | | | | | | | 13 (4) 6 (1) | | 4 (1) 1 (0) | | | | 3 (0) 1 (0) | |
| 28 (181) | | 2 (4) 1 (1) | | | | 12 (1) 5 (0) | | | 4 (4) 2 (1) | | 3 (2) 1 (1) | 7 (1) 3 (0) | | | | | | | 3 (1) 1 (0) | | |
| W (45) | | | | | | | | | | | | | 9 (0) 3 (0) | | | | | | | 5 (0) 1 (0) | |
| 22 (49) | | | | | 3 (0) 1 (0) | | | 6 (0) 3 (0) | | | | 2 (0) 1 (0) | | | | | | | | | |
| 18 (217) | | 10 (5) 4 (1) | 10 (2) 2 (0) | | 6 (4) 2 (1) | 2 (2) 1 (0) | | | 5 (5) 2 (2) | 4 (3) 2 (1) | 6 (3) 3 (1) | | | 2 (4) 1 (1) | | 3 (1) 1 (0) | | | 4 (1) 1 (0) | | 2 (0) 1 (0) |
| E26C13 (14) | | | | | 3 (0) 1 (0) | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 32 (60) | | | | | | | 2 (0) 1 (0) | | 5 (1) 2 (0) | | | | | | | | | | | | |
| Un (2870) | 2 (41) 1 (12) | 6 (78) 3 (24) | 13 (32) 6 (9) | | 21 (57) 10 (20) | 4 (27) 1 (8) | | 16 (23) 7 (9) | 15 (72) 7 (27) | 7 (44) 3 (16) | 7 (43) 3 (17) | | | 7 (64) 3 (24) | 2 (12) 1 (4) | 2 (23) 1 (8) | | 4 (19) 2 (6) | | 8 (11) 3 (4) | |
| 16 (22) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| E22C19W28 (5) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| E50C23 (2) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
|