| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | rat tetra | 6 (920) | 12 (596) | 7 (1261) | 10 (1694) | X (925) | 9 (791) | 19 (570) | 1 (2932) | 16 (597) | 17 (653) | 3 (1699) | 15 (674) | 2 (1391) | 13 (660) | 11 (563) | 4 (1399) | 14 (718) | 5 (1368) | 18 (560) | 20 (586) | 8 (1135) | Un (288) |
| chr10 (359) | 121 (8) 29 (2) | 2 (4) 1 (1) | 2 (7) 1 (2) | 3 (11) 1 (4) | | | | 12 (12) 4 (4) | 4 (3) 1 (1) | | 17 (11) 6 (4) | 11 (3) 3 (1) | 4 (9) 2 (3) | | | 3 (7) 1 (2) | 2 (4) 1 (1) | 19 (9) 8 (3) | | 4 (2) 2 (0) | 5 (7) 2 (2) | |
| chr12 (376) | | 47 (5) 10 (1) | | 11 (12) 3 (4) | | | 2 (4) 1 (1) | 6 (13) 3 (5) | 5 (3) 2 (1) | 11 (4) 5 (1) | 10 (11) 4 (4) | | 30 (10) 11 (3) | | 13 (4) 4 (1) | 4 (7) 2 (2) | 17 (4) 6 (1) | | 6 (3) 3 (1) | | | |
| chr8 (864) | 6 (21) 3 (6) | 2 (11) 1 (3) | 59 (17) 19 (6) | 6 (28) 3 (11) | 2 (8) 1 (3) | 5 (10) 2 (3) | 4 (10) 2 (3) | 43 (30) 17 (11) | 7 (8) 3 (3) | 6 (9) 3 (3) | 21 (27) 7 (9) | 2 (8) 1 (2) | 31 (23) 12 (8) | 9 (10) 3 (3) | | 30 (17) 10 (6) | 4 (10) 2 (4) | 38 (24) 14 (9) | 13 (7) 3 (2) | | 11 (17) 3 (6) | |
| chr3 (658) | | 10 (8) 4 (2) | 4 (13) 2 (4) | 61 (21) 21 (8) | 7 (6) 3 (2) | 9 (8) 4 (3) | | 18 (23) 8 (8) | | 4 (7) 2 (2) | 8 (20) 4 (7) | | 4 (17) 2 (6) | 12 (7) 5 (2) | 7 (7) 3 (2) | 6 (13) 3 (4) | 6 (7) 1 (3) | 20 (18) 9 (6) | | 7 (4) 2 (1) | 6 (13) 2 (4) | 2 (0) 1 (0) |
| chr1 (294) | | 2 (4) 1 (1) | 7 (6) 3 (2) | 17 (9) 7 (3) | 23 (2) 8 (1) | | | 2 (10) 1 (4) | | | | 2 (2) 1 (0) | 15 (7) 4 (2) | 17 (3) 5 (1) | 2 (3) 1 (1) | | 4 (3) 2 (1) | 23 (8) 6 (3) | 7 (2) 3 (0) | | | 2 (0) 1 (0) |
| chr2 (856) | 16 (21) 6 (6) | 11 (11) 2 (3) | 17 (17) 6 (6) | 32 (28) 14 (11) | 24 (8) 9 (3) | 38 (10) 12 (3) | 2 (10) 1 (3) | 31 (30) 10 (11) | 15 (8) 4 (3) | 5 (9) 1 (3) | 60 (27) 13 (9) | 30 (8) 8 (2) | 21 (22) 9 (8) | 11 (10) 4 (3) | 28 (9) 10 (3) | 14 (17) 5 (6) | 14 (10) 5 (4) | 8 (23) 4 (9) | | 7 (5) 2 (2) | 4 (16) 2 (5) | |
| chr5 (543) | 2 (13) 1 (4) | 4 (7) 2 (2) | 5 (11) 2 (4) | 8 (17) 4 (7) | 4 (5) 2 (2) | 4 (6) 2 (2) | 30 (6) 8 (2) | 28 (19) 12 (7) | 5 (5) 1 (1) | 2 (5) 1 (2) | 40 (17) 14 (6) | 3 (5) 1 (1) | 11 (14) 5 (5) | 8 (6) 2 (2) | 4 (6) 2 (2) | | 2 (6) 1 (2) | 6 (15) 3 (5) | 2 (4) 1 (1) | 8 (3) 3 (1) | 12 (10) 4 (3) | |
| chr13 (203) | 3 (5) 1 (1) | | 14 (4) 5 (1) | | | 2 (2) 1 (0) | 3 (2) 1 (0) | 25 (7) 9 (2) | 5 (2) 2 (0) | 5 (2) 2 (0) | 8 (6) 3 (2) | | | | | 17 (4) 5 (1) | 2 (2) 1 (0) | | | | | |
| chr18 (307) | | 2 (4) 1 (1) | 7 (6) 2 (2) | 16 (10) 6 (3) | | 4 (3) 2 (1) | 12 (3) 4 (1) | 10 (10) 4 (4) | 14 (3) 6 (1) | | 7 (9) 3 (3) | | 20 (8) 5 (3) | | | 6 (6) 2 (2) | 6 (3) 3 (1) | 12 (8) 5 (3) | | 3 (1) 1 (0) | 2 (6) 1 (2) | |
| chr6 (401) | 6 (9) 3 (3) | 2 (5) 1 (1) | 14 (8) 5 (2) | | 2 (3) 1 (1) | 4 (5) 2 (1) | 3 (4) 1 (1) | 4 (14) 2 (5) | 7 (4) 2 (1) | 15 (4) 6 (1) | 7 (12) 3 (4) | 2 (3) 1 (1) | 21 (10) 7 (3) | 6 (4) 2 (1) | 13 (4) 5 (1) | 15 (8) 4 (3) | 15 (4) 7 (1) | 9 (11) 3 (4) | 4 (3) 2 (1) | | 19 (7) 6 (2) | |
| chr7 (982) | 4 (24) 2 (7) | 21 (13) 8 (4) | 4 (20) 2 (7) | 65 (32) 26 (12) | 8 (9) 4 (3) | | 21 (11) 8 (4) | 52 (34) 19 (13) | 8 (9) 3 (3) | 4 (10) 2 (4) | 16 (31) 7 (11) | 4 (9) 2 (3) | 13 (26) 4 (9) | 2 (11) 1 (4) | 13 (11) 4 (4) | 18 (20) 7 (7) | 4 (11) 2 (4) | 8 (27) 4 (10) | 20 (8) 8 (3) | 2 (6) 1 (2) | 34 (19) 11 (6) | |
| chr17 (259) | 14 (6) 5 (2) | | 2 (5) 1 (1) | 2 (8) 1 (3) | | 18 (3) 6 (1) | 5 (3) 2 (1) | 14 (9) 6 (3) | 6 (2) 3 (0) | 4 (2) 2 (1) | 9 (8) 4 (2) | 3 (2) 1 (0) | 4 (6) 1 (2) | | | 6 (5) 2 (1) | 3 (3) 1 (1) | 2 (7) 1 (2) | | 5 (1) 2 (0) | 14 (5) 4 (1) | |
| chr19 (198) | 6 (4) 3 (1) | 2 (2) 1 (0) | 16 (4) 5 (1) | 4 (6) 2 (2) | | | | 4 (7) 2 (2) | | 4 (2) 2 (0) | 2 (6) 1 (2) | | 5 (5) 2 (1) | 4 (2) 2 (0) | | 10 (4) 5 (1) | 2 (2) 1 (0) | 2 (5) 1 (2) | | | | |
| chr16 (229) | 4 (5) 2 (1) | 6 (3) 2 (0) | 6 (4) 2 (1) | 21 (7) 7 (2) | | 3 (2) 1 (1) | 8 (2) 3 (0) | 7 (8) 3 (3) | | | 4 (7) 2 (2) | 3 (2) 1 (0) | 2 (6) 1 (2) | 2 (2) 1 (1) | 7 (2) 2 (0) | | | | | | 12 (4) 6 (1) | |
| chr14 (273) | 19 (6) 9 (2) | | | 7 (8) 3 (3) | 7 (2) 2 (1) | 10 (3) 3 (1) | 5 (3) 1 (1) | 23 (9) 6 (3) | | 6 (2) 3 (1) | 2 (8) 1 (3) | 9 (2) 2 (0) | | 10 (3) 4 (1) | | 2 (5) 1 (2) | | 4 (7) 1 (2) | | 9 (1) 3 (0) | | |
| chr9 (1064) | 13 (26) 5 (8) | 5 (14) 2 (4) | 10 (22) 4 (7) | 24 (34) 10 (13) | 4 (9) 2 (3) | 7 (13) 3 (4) | 8 (12) 4 (4) | 18 (37) 7 (14) | 12 (10) 4 (3) | 11 (11) 4 (4) | 34 (33) 14 (12) | 10 (10) 5 (3) | 28 (28) 11 (10) | 14 (12) 7 (4) | 6 (12) 2 (4) | 31 (21) 12 (8) | 12 (12) 5 (5) | 49 (29) 17 (11) | 5 (8) 2 (3) | 8 (6) 4 (2) | 26 (21) 10 (7) | 4 (0) 2 (0) |
| chr4 (352) | | | 5 (7) 2 (2) | 8 (11) 4 (4) | 2 (3) 1 (1) | | 3 (4) 1 (1) | 7 (12) 3 (4) | 2 (3) 1 (1) | 12 (3) 4 (1) | 24 (11) 9 (4) | 7 (3) 3 (1) | 13 (9) 5 (3) | 4 (4) 2 (1) | 2 (4) 1 (1) | 2 (7) 1 (2) | 5 (4) 2 (1) | 10 (9) 4 (3) | 7 (2) 2 (1) | | 4 (6) 2 (2) | |
| chr11 (169) | | | 3 (3) 1 (1) | | | | | | | | 4 (5) 2 (1) | 2 (1) 1 (0) | 6 (4) 2 (1) | 2 (2) 1 (0) | 2 (1) 1 (0) | 4 (3) 2 (1) | 2 (1) 1 (0) | 14 (4) 6 (1) | | 2 (1) 1 (0) | 10 (3) 4 (1) | |
| chr15 (228) | 3 (5) 1 (1) | 5 (3) 2 (0) | 4 (4) 2 (1) | 2 (7) 1 (2) | | 7 (2) 3 (1) | | 6 (8) 3 (3) | | | 6 (7) 3 (2) | | 9 (6) 4 (2) | 4 (2) 1 (1) | 4 (2) 2 (0) | 7 (4) 3 (1) | | 9 (6) 4 (2) | 8 (1) 3 (0) | | 10 (4) 3 (1) | |
| chr21 (194) | 2 (4) 1 (1) | | 3 (4) 1 (1) | 2 (6) 1 (2) | | | | 6 (6) 2 (2) | | 6 (2) 3 (0) | 2 (6) 1 (2) | | | | | 7 (3) 2 (1) | 4 (2) 2 (0) | 11 (5) 3 (2) | 2 (1) 1 (0) | 2 (1) 1 (0) | 5 (3) 1 (1) | |
| chr20 (63) | | | 2 (1) 1 (0) | 2 (2) 1 (0) | | | | | | | | | | | | | | 3 (1) 1 (0) | | | 2 (1) 1 (0) | |
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