| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | mmouse tetra | 12 (852) | 5 (1478) | X (1116) | 15 (953) | 14 (898) | 11 (1877) | 8 (1189) | 7 (2003) | 10 (1205) | 4 (1499) | 13 (1012) | 17 (1157) | 1 (1504) | 6 (1282) | 2 (2058) | 9 (1394) | 3 (1237) | 16 (811) | 19 (795) | 18 (628) |
| chr10 (359) | 104 (6) 26 (2) | 8 (9) 4 (3) | | 2 (5) 1 (1) | 11 (4) 3 (1) | 3 (12) 1 (4) | | | 2 (6) 1 (2) | 21 (9) 9 (3) | | 9 (4) 4 (2) | 2 (7) 1 (2) | | 14 (12) 5 (4) | 4 (7) 2 (2) | 4 (6) 2 (2) | | | |
| chr12 (376) | | 59 (10) 12 (3) | | | | 23 (12) 8 (5) | 9 (6) 4 (2) | | 3 (7) 1 (2) | | 37 (5) 15 (2) | 2 (5) 1 (2) | | 2 (6) 1 (2) | 9 (12) 4 (4) | | | 17 (5) 5 (2) | 4 (3) 2 (1) | 5 (3) 2 (1) |
| chr1 (294) | | 4 (7) 2 (2) | 29 (2) 11 (1) | | 3 (3) 1 (1) | 9 (10) 4 (3) | 2 (5) 1 (1) | | 7 (5) 3 (2) | 21 (7) 4 (2) | | 6 (4) 3 (1) | 14 (6) 5 (2) | 2 (4) 1 (1) | | | 18 (5) 4 (1) | 3 (4) 1 (1) | | 5 (2) 2 (0) |
| chr8 (864) | 6 (15) 3 (4) | 9 (23) 4 (7) | 2 (8) 1 (3) | 47 (13) 15 (4) | 5 (11) 2 (3) | 10 (29) 5 (11) | 4 (15) 2 (5) | 15 (16) 7 (6) | 13 (16) 5 (6) | 38 (22) 15 (8) | 9 (11) 4 (4) | 4 (11) 1 (4) | 10 (18) 3 (7) | 23 (14) 8 (5) | 25 (28) 10 (10) | 16 (18) 6 (7) | 25 (16) 9 (5) | | 10 (7) 4 (2) | 12 (7) 3 (2) |
| chr2 (856) | 18 (15) 6 (4) | 21 (22) 7 (7) | 20 (8) 9 (3) | 10 (13) 3 (4) | 39 (11) 8 (3) | 33 (29) 14 (11) | 13 (15) 5 (5) | 14 (16) 6 (6) | 16 (16) 6 (6) | 6 (22) 3 (8) | 4 (11) 2 (4) | 8 (11) 4 (4) | 45 (18) 16 (7) | 16 (14) 6 (5) | 55 (28) 14 (10) | 4 (18) 2 (7) | 23 (16) 9 (5) | 26 (11) 10 (4) | 15 (6) 3 (2) | 5 (7) 1 (2) |
| chr3 (658) | | 16 (17) 5 (6) | 9 (6) 4 (2) | 3 (10) 1 (3) | 2 (8) 1 (2) | 56 (22) 19 (8) | | 11 (12) 4 (4) | 8 (12) 3 (4) | 19 (17) 8 (6) | 12 (8) 6 (3) | 7 (8) 3 (3) | 21 (14) 9 (5) | 4 (10) 2 (4) | 11 (22) 5 (8) | 4 (14) 2 (5) | 5 (12) 2 (4) | 15 (9) 7 (3) | 5 (5) 2 (1) | |
| chr5 (543) | | 10 (14) 4 (4) | 2 (5) 1 (2) | 2 (8) 1 (2) | 3 (7) 1 (2) | 6 (18) 3 (7) | 34 (9) 10 (3) | 20 (10) 8 (3) | 16 (10) 6 (3) | 6 (14) 3 (5) | 3 (7) 1 (2) | 7 (7) 3 (3) | 9 (11) 3 (4) | 3 (8) 1 (3) | 40 (18) 15 (6) | 17 (11) 6 (4) | 6 (10) 3 (3) | 8 (7) 4 (2) | 5 (4) 2 (1) | 4 (4) 2 (1) |
| chr13 (203) | 3 (3) 1 (1) | 6 (5) 3 (1) | | 13 (3) 4 (1) | 2 (2) 1 (0) | | 3 (3) 1 (1) | 23 (3) 8 (1) | 6 (3) 2 (1) | | | 2 (2) 1 (1) | | 17 (3) 4 (1) | 13 (6) 5 (2) | | | | 2 (1) 1 (0) | |
| chr14 (273) | 15 (4) 7 (1) | 2 (7) 1 (2) | 9 (2) 3 (1) | | 9 (3) 2 (1) | 5 (9) 2 (3) | 4 (4) 1 (1) | 2 (5) 1 (2) | 23 (5) 7 (1) | 6 (7) 3 (2) | 2 (3) 1 (1) | 20 (3) 7 (1) | 8 (5) 3 (2) | 4 (4) 2 (1) | 2 (9) 1 (3) | | | | | 6 (2) 3 (0) |
| chr11 (169) | | | | | | 2 (5) 1 (2) | | | 6 (3) 2 (1) | 17 (4) 7 (1) | 3 (2) 1 (0) | 6 (2) 2 (0) | 2 (3) 1 (1) | 4 (2) 2 (1) | 2 (5) 1 (2) | 13 (3) 6 (1) | 2 (3) 1 (1) | 2 (2) 1 (0) | | |
| chr7 (982) | 2 (17) 1 (5) | 15 (26) 6 (8) | 8 (9) 4 (3) | 8 (15) 3 (5) | 4 (12) 2 (3) | 62 (33) 24 (13) | 27 (17) 11 (6) | 44 (18) 15 (7) | 5 (18) 2 (6) | 6 (25) 3 (9) | 5 (13) 2 (5) | 4 (13) 2 (5) | 2 (21) 1 (8) | 16 (16) 7 (5) | 16 (32) 7 (11) | 32 (21) 13 (8) | 9 (18) 3 (6) | 12 (13) 4 (5) | 11 (7) 4 (2) | 17 (8) 7 (3) |
| chr6 (401) | 4 (7) 2 (2) | 31 (10) 9 (3) | 2 (3) 1 (1) | 11 (6) 5 (2) | 2 (5) 1 (1) | 6 (13) 3 (5) | 9 (7) 3 (2) | | 5 (7) 2 (2) | 10 (10) 4 (4) | 13 (5) 5 (2) | 4 (5) 2 (2) | 12 (8) 4 (3) | | 16 (13) 5 (4) | 24 (8) 8 (3) | 7 (7) 1 (2) | 12 (5) 5 (2) | 2 (3) 1 (1) | 4 (3) 2 (1) |
| chr17 (259) | 2 (4) 1 (1) | 2 (6) 1 (2) | | | 6 (3) 3 (1) | 5 (8) 2 (3) | 15 (4) 7 (1) | 2 (4) 1 (1) | 6 (4) 3 (1) | 4 (6) 2 (2) | 4 (3) 1 (1) | 15 (3) 6 (1) | 15 (5) 4 (2) | 4 (4) 2 (1) | 11 (8) 5 (3) | 17 (5) 4 (2) | 5 (4) 2 (1) | | 9 (2) 3 (0) | |
| chr18 (307) | | 7 (8) 3 (2) | | 9 (4) 3 (1) | 6 (3) 2 (1) | 17 (10) 6 (4) | 17 (5) 6 (2) | 4 (5) 1 (2) | 7 (5) 3 (2) | 7 (8) 3 (3) | 2 (4) 1 (1) | 5 (4) 2 (1) | 2 (6) 1 (2) | 6 (5) 2 (1) | 7 (10) 3 (3) | | 14 (5) 3 (2) | 2 (4) 1 (1) | 4 (2) 2 (0) | |
| chr19 (198) | 2 (3) 1 (1) | 9 (5) 4 (1) | | 6 (3) 2 (1) | | 4 (6) 2 (2) | 2 (3) 1 (1) | 2 (3) 1 (1) | 14 (3) 4 (1) | 2 (5) 1 (2) | | | 4 (4) 2 (1) | 5 (3) 2 (1) | 9 (6) 4 (2) | | 5 (3) 2 (1) | | | |
| chr16 (229) | | 6 (6) 2 (2) | | | 3 (2) 1 (0) | 21 (7) 7 (3) | 5 (4) 2 (1) | 7 (4) 3 (1) | 3 (4) 1 (1) | | | 2 (3) 1 (1) | 2 (4) 1 (1) | | 2 (7) 1 (2) | 12 (4) 6 (1) | 7 (4) 3 (1) | 6 (3) 2 (1) | | |
| chr4 (352) | | 5 (9) 2 (3) | 2 (3) 1 (1) | 10 (5) 3 (1) | 7 (4) 3 (1) | 4 (12) 2 (4) | 5 (6) 2 (2) | 4 (6) 2 (2) | 2 (6) 1 (2) | 7 (9) 3 (3) | 10 (4) 4 (1) | 2 (4) 1 (2) | 4 (7) 2 (2) | 2 (5) 1 (2) | 26 (11) 8 (4) | 4 (7) 2 (2) | | 4 (4) 2 (1) | 3 (2) 1 (1) | 5 (2) 2 (1) |
| chr15 (228) | 2 (4) 1 (1) | 8 (6) 4 (2) | | 2 (3) 1 (1) | | | | 4 (4) 2 (1) | 9 (4) 4 (1) | 8 (5) 3 (2) | | | 11 (4) 4 (1) | 5 (3) 2 (1) | 4 (7) 2 (2) | 7 (4) 3 (1) | 13 (4) 5 (1) | 6 (3) 3 (1) | | 5 (1) 2 (0) |
| chr21 (194) | | 4 (5) 2 (1) | | 3 (3) 1 (1) | | 6 (6) 3 (2) | | 3 (3) 1 (1) | 2 (3) 1 (1) | 13 (5) 4 (1) | 7 (2) 3 (1) | 2 (2) 1 (1) | | 5 (3) 1 (1) | 3 (6) 1 (2) | 4 (4) 1 (1) | | | | 2 (1) 1 (0) |
| chr9 (1064) | 4 (19) 2 (6) | 13 (28) 5 (9) | 2 (10) 1 (4) | 13 (16) 4 (5) | 13 (13) 5 (4) | 30 (36) 12 (14) | 8 (18) 4 (7) | 9 (19) 4 (7) | 10 (19) 5 (7) | 41 (27) 15 (10) | 7 (14) 3 (5) | 16 (14) 7 (6) | 30 (23) 14 (8) | 27 (17) 9 (6) | 32 (35) 12 (12) | 30 (23) 11 (8) | 27 (20) 11 (7) | 10 (14) 3 (5) | 2 (8) 1 (3) | 5 (8) 2 (3) |
| chr20 (63) | | 3 (1) 1 (0) | | | | 2 (2) 1 (0) | | 2 (1) 1 (0) | 3 (1) 1 (0) | | | | | 2 (1) 1 (0) | | 4 (1) 2 (0) | | | | |
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