| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | mmouse rat | 4 (1499) | 5 (1478) | 6 (1282) | 18 (628) | 13 (1012) | 7 (2003) | X (1116) | 3 (1237) | 14 (898) | 2 (2058) | 11 (1877) | 16 (811) | 8 (1189) | 9 (1394) | 15 (953) | 12 (852) | 1 (1504) | 19 (795) | 10 (1205) | 17 (1157) |
| 5 (1368) | 992 (61) 22 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | 41 (60) 2 (1) | | | |
| 12 (596) | | 421 (25) 13 (0) | | | | | | | | | | | 30 (20) 2 (0) | | | | | | | |
| 4 (1399) | | 114 (59) 9 (2) | 830 (52) 18 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 18 (560) | | | | 374 (10) 8 (0) | | | 2 (14) 1 (0) | | | | | | | | | | | | | |
| 17 (653) | | | | 23 (11) 3 (0) | 346 (15) 18 (0) | | | | | 86 (42) 3 (0) | | | | | | | | | | |
| 1 (2932) | | | | | 20 (70) 1 (3) | 1330 (176) 40 (5) | | | | | | | | | | 2 (68) 1 (2) | | 560 (74) 9 (1) | 124 (94) 7 (4) | 82 (98) 11 (5) |
| X (925) | | | | | | | 553 (23) 36 (1) | | | | | | | | | | | | | |
| 2 (1391) | | | | | 163 (33) 10 (1) | | | 768 (48) 22 (1) | | | | | | 2 (53) 1 (2) | 80 (34) 4 (1) | | | | | |
| 15 (674) | | | | | | | | | 449 (17) 20 (0) | | | | | | | | | | | |
| 3 (1699) | | | | | | | | | | 1355 (110) 18 (1) | | | | | | | | | | |
| 10 (1694) | | | | | | | | | | | 1153 (100) 25 (2) | 88 (39) 3 (1) | | | | | | | | 130 (57) 3 (2) |
| 11 (563) | | | | | | | | | | | | 423 (13) 12 (0) | | | | | | | | |
| 19 (570) | | 7 (24) 1 (0) | | | | | | | | | | | 432 (20) 8 (0) | | | | | | | |
| 8 (1135) | | | | | | | | | | | | | | 829 (43) 27 (1) | | | | | | |
| 7 (1261) | | | | | 2 (30) 1 (1) | | | | | | | | | 3 (48) 1 (1) | 476 (31) 16 (1) | | | | 365 (40) 12 (1) | 26 (42) 2 (2) |
| 6 (920) | | 40 (39) 2 (1) | | | | | | | | | | | | | | 511 (21) 16 (0) | | | | 79 (30) 3 (1) |
| 9 (791) | | | | | | | | | | | | | | | | | 424 (34) 5 (0) | | | 161 (26) 9 (1) |
| 13 (660) | | | | | | | | | | | | | | | | | 502 (29) 10 (0) | | | |
| 14 (718) | | 361 (30) 7 (1) | | | | | | | | | 149 (42) 4 (1) | | | | | | | | | |
| 16 (597) | | | | | | | | | 114 (15) 3 (0) | | | | 315 (21) 12 (0) | | | | | | | |
| 20 (586) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 221 (18) 12 (0) | 210 (19) 7 (1) |
| Un (288) | | 3 (12) 1 (0) | | | | | 2 (7) 1 (0) | | | | 10 (17) 2 (0) | 3 (6) 1 (0) | | 3 (11) 1 (0) | | 3 (6) 1 (0) | 8 (12) 2 (0) | | 7 (9) 2 (0) | 53 (9) 2 (0) |
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