| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | homo mmouse | 1 (2165) | 14 (709) | X (869) | 20 (636) | 17 (1222) | 19 (1377) | 2 (1455) | 6 (1113) | 16 (946) | 4 (849) | 5 (1008) | 11 (1415) | 3 (1138) | 12 (1088) | 18 (306) | 8 (788) | 13 (377) | 7 (1063) | 10 (839) | 9 (844) | 22 (528) | 15 (679) | 21 (261) | Y (110) | DR51 (2) |
| 4 (1499) | 596 (93) 16 (3) | | | | | | | 40 (46) 2 (2) | | | | | | | | 53 (30) 3 (1) | | | | 236 (34) 15 (2) | | | | | |
| 12 (852) | | 356 (17) 9 (0) | | | | | 81 (32) 8 (1) | | | | | | | | | | | 53 (23) 5 (1) | | | | | | | |
| X (1116) | | | 483 (21) 42 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 2 (2058) | | | | 445 (36) 11 (0) | | | 189 (77) 11 (4) | | | | | 170 (84) 13 (3) | | | | | | | 88 (48) 4 (2) | 215 (47) 12 (3) | | 140 (36) 2 (1) | | | |
| 11 (1877) | 27 (117) 4 (3) | | | | 931 (70) 31 (2) | | 56 (71) 2 (3) | | 6 (49) 1 (1) | | 150 (51) 9 (2) | | | | | | | 43 (50) 4 (2) | | | 47 (24) 1 (1) | | | | |
| 7 (2003) | | | | | | 430 (68) 22 (3) | 2 (75) 1 (3) | | 157 (52) 9 (2) | | | 344 (81) 18 (3) | | | | | | | 71 (46) 2 (2) | | | 112 (35) 12 (1) | | | |
| 1 (1504) | 429 (93) 12 (3) | | | | | | 382 (56) 16 (2) | 35 (46) 4 (2) | | | 7 (41) 2 (2) | | | | 17 (12) 1 (0) | 45 (30) 2 (1) | 9 (15) 1 (1) | | | | | | | | |
| 17 (1157) | | | | | | 80 (39) 5 (1) | 85 (43) 4 (2) | 326 (35) 11 (1) | 113 (30) 3 (1) | | 14 (31) 3 (1) | | 10 (40) 1 (1) | | 23 (9) 2 (0) | | | | | | | | 18 (6) 1 (0) | | |
| 8 (1189) | 36 (74) 1 (2) | | | | | 166 (40) 6 (1) | | | 298 (31) 8 (1) | 93 (27) 6 (1) | | | | | | 106 (24) 12 (1) | 47 (12) 4 (0) | | 4 (27) 1 (1) | | 5 (15) 1 (0) | | | | |
| 5 (1478) | 23 (92) 1 (3) | | 2 (28) 1 (2) | | | | 50 (55) 1 (2) | | | 303 (33) 8 (1) | | | | 189 (48) 5 (1) | | | 35 (15) 1 (1) | 296 (40) 17 (2) | | | 20 (19) 3 (1) | | | | |
| 13 (1012) | 16 (63) 2 (2) | | | | | | | 120 (31) 8 (1) | | | 255 (27) 15 (1) | | | | | 3 (20) 1 (1) | | 21 (27) 1 (1) | 17 (23) 3 (1) | 55 (23) 5 (1) | | | | | |
| 19 (795) | | | | | | | | | | | | 252 (32) 4 (1) | | | | | | | 207 (18) 5 (0) | 64 (18) 5 (1) | | | | | |
| 16 (811) | 3 (50) 1 (1) | | | | | | | | 81 (21) 4 (0) | | | | 239 (28) 13 (1) | 4 (26) 1 (0) | | 6 (16) 1 (1) | | | | | 46 (10) 5 (0) | | 93 (4) 3 (0) | | |
| 10 (1205) | | | | | | 113 (41) 4 (1) | 7 (45) 1 (2) | 194 (37) 8 (1) | | | | | | 258 (39) 7 (1) | | | | | 78 (28) 3 (1) | | 25 (15) 4 (0) | | 36 (7) 2 (0) | | |
| 18 (628) | | | | | | | 11 (23) 1 (1) | | | | 185 (17) 5 (0) | | | | 165 (5) 8 (0) | | | | 21 (14) 4 (0) | | | | | | |
| 15 (953) | | | | | | | | | | | 77 (26) 5 (1) | | | 157 (31) 3 (0) | | 187 (19) 6 (1) | | | | | 175 (12) 5 (0) | | | | |
| 14 (898) | 2 (56) 1 (1) | 151 (18) 6 (0) | | | | | | 3 (27) 1 (1) | | | | | 84 (31) 7 (1) | | | 77 (18) 3 (1) | 146 (9) 12 (0) | | 82 (21) 5 (1) | | | | | | |
| 3 (1237) | 422 (77) 12 (2) | | | | | | | | | 153 (28) 9 (1) | | | 118 (42) 7 (2) | | | 28 (25) 3 (1) | 20 (12) 1 (0) | | | | | | | | |
| 6 (1282) | 5 (80) 1 (2) | | | | | | 81 (48) 4 (2) | | | 18 (29) 3 (1) | | | 134 (44) 7 (2) | 204 (41) 10 (1) | | | | 253 (34) 7 (1) | 17 (30) 2 (1) | | 13 (17) 1 (1) | | | | |
| 9 (1394) | | | | | | 60 (47) 4 (2) | | 53 (43) 2 (2) | | | | 255 (57) 7 (2) | 280 (48) 8 (2) | | | | | 10 (37) 3 (2) | | | | 196 (25) 7 (1) | | | |
|