| first line: shared orthologs (random expectation); second: number of synteny blocks (random expectation); color marks over-/under- representation of orthologs (p-value<1%) | homo chicken | 4 (849) | 6 (1113) | 10 (839) | 14 (709) | 1 (2165) | 2 (1455) | 15 (679) | 20 (636) | 12 (1088) | 5 (1008) | 9 (844) | 3 (1138) | 8 (788) | 16 (946) | 17 (1222) | 19 (1377) | 11 (1415) | 13 (377) | X (869) | 7 (1063) | 22 (528) | 18 (306) | 21 (261) | DR51 (2) | Y (110) |
| 4 (1178) | 461 (31) 36 (2) | | | | | 29 (49) 4 (4) | | 11 (20) 2 (2) | | | | | 38 (25) 7 (1) | | | | | | 174 (19) 32 (2) | | | | | | |
| 3 (1267) | | 414 (39) 15 (2) | | | 126 (73) 8 (7) | 225 (53) 22 (4) | | 27 (21) 5 (2) | | | | | 43 (27) 5 (2) | | | | 24 (35) 1 (3) | | | | | | | | |
| 6 (549) | | | 349 (14) 38 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 5 (931) | | | | 334 (18) 11 (0) | | | 63 (18) 6 (2) | | 2 (28) 1 (1) | | | | | | | | 223 (26) 24 (2) | | | | | | | | |
| 8 (561) | | | | 4 (10) 1 (0) | 376 (32) 16 (3) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 7 (561) | | | | | | 321 (23) 19 (2) | | | 2 (16) 1 (1) | | | 25 (22) 4 (2) | | | | | | | | | | | 13 (3) 2 (0) | | |
| 10 (421) | | | | | | 2 (17) 1 (1) | 273 (8) 31 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 20 (361) | | | | | | | 2 (7) 1 (0) | 226 (6) 20 (0) | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 1 (2080) | | | 16 (54) 3 (6) | | 46 (120) 9 (12) | 45 (87) 1 (7) | 7 (41) 3 (5) | | 344 (62) 21 (4) | | | 104 (83) 11 (9) | | | | | 102 (58) 9 (6) | 231 (27) 10 (1) | 114 (33) 5 (4) | 149 (56) 14 (5) | 146 (28) 6 (2) | | 105 (14) 4 (0) | | |
| 13 (352) | | | | | | | | | | 221 (10) 24 (1) | | | | | | | | | | | | | | | |
| 17 (313) | | | | | | | | | | | 199 (7) 16 (0) | | | | | | | | | | | | | | |
| 9 (463) | | | | | | 89 (19) 11 (1) | | | | | | 220 (18) 22 (2) | | | | | | | | | | | 6 (3) 2 (0) | | |
| 2 (1432) | | 79 (45) 7 (2) | 75 (37) 2 (4) | | 9 (83) 1 (8) | | | | | 46 (42) 7 (5) | 16 (32) 4 (3) | 146 (57) 15 (6) | 230 (30) 11 (2) | | | | | | | 204 (38) 15 (3) | | 120 (12) 12 (1) | | | |
| 11 (304) | | | | | | | | | | | | | | 173 (6) 25 (1) | | 27 (2) 1 (0) | | | | | | | | | |
| 19 (332) | | | | | | | | | | | | | | | 179 (10) 21 (1) | | | | | 48 (9) 8 (0) | | | | | |
| 28 (181) | | | | | | | | | | | | | | | | 111 (1) 21 (0) | | | | | | | | | |
| 12 (369) | | | | | | | | | | | 17 (8) 2 (1) | 213 (14) 29 (1) | | | | | | | | | | | | | |
| 14 (518) | | 3 (16) 1 (0) | 9 (13) 2 (1) | | 4 (30) 1 (3) | 6 (21) 3 (1) | | 34 (8) 4 (0) | | | | | | 163 (11) 25 (1) | 30 (15) 3 (2) | | | | | 77 (14) 8 (1) | | 11 (4) 1 (0) | | | |
| 15 (374) | | | | | | | | | 156 (11) 7 (0) | | | | | | | | | | | | 96 (5) 13 (0) | | | | |
| 18 (217) | | | | | | | | | | | | | | | 146 (6) 17 (0) | | | | | | | | | | |
| 21 (231) | | | | | 148 (13) 12 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| Z (369) | 7 (9) 3 (0) | | | | | | | | | 128 (10) 12 (1) | 83 (8) 12 (1) | | 7 (7) 2 (0) | | | | | | | | | 2 (3) 1 (0) | | | |
| 24 (185) | | | | | | | | | | | | | | | | | 120 (5) 10 (0) | | | | | | | | |
| 23 (212) | | | | | 128 (12) 20 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 26 (185) | | 43 (5) 5 (0) | | | 84 (10) 6 (1) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 27 (116) | | | | 2 (2) 1 (0) | | | | | | | | | | | 60 (3) 13 (0) | | | | | | | | | | |
| W (45) | | | | | | | | | | 28 (1) 2 (0) | | | | | | | | | | | | | | | |
| 32 (60) | | 9 (1) 2 (0) | | | 30 (3) 6 (0) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 22 (49) | | | | | | 8 (2) 1 (0) | | 6 (0) 1 (0) | | | | | 18 (1) 1 (0) | | | | | | | | | | | | |
| E26C13 (14) | | | | | 12 (0) 3 (0) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| 16 (22) | | 3 (0) 1 (0) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| E22C19W28 (5) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| Un (2870) | 2 (76) 1 (6) | 6 (90) 1 (5) | 18 (75) 8 (8) | 5 (55) 2 (2) | 64 (166) 20 (16) | 16 (120) 5 (10) | 7 (57) 3 (7) | 2 (49) 1 (5) | 29 (86) 8 (6) | 19 (84) 6 (10) | 12 (65) 3 (7) | 7 (115) 3 (13) | 47 (62) 4 (4) | 26 (63) 8 (10) | 24 (88) 9 (11) | 18 (25) 8 (4) | 15 (80) 6 (8) | | | 4 (78) 2 (7) | 2 (39) 1 (3) | 23 (25) 5 (3) | | | |
| E50C23 (2) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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